pipelines

La plateforme MOABI met à disposition, via l'interface G-route, des pipelines (chaînes de traitements) de routine diagnostique tout en garantissant une reproductibilité entre les analyses, les patients et cela dans le temps. Ceux-ci se doivent d’être robustes tant au niveau fonctionnel qu’évolutif. Pour cela, le service se doit d’être de qualité et les processus d’évolutions contrôlés.

Correspondances des noms de pipelines

Dans le but de couvrir un maximum de types d'analyses, MOABI a mis en place une nomenclature pour nommer les pipelines. Voici un tableau de correspondances:

Pipelines spécifiques

En plus des pipelines génériques, la plateforme MOABI a également mis en place des pipelines spécifiques en collaboration avec les hôpitaux de l'AP-HP.

Architecture technique du fonctionnement des pipelines

Afin de garantir la reproductibilité et la tracabilité des analyses des données de séquençage, la stratégie mise en place est la suivante.